Mit Abklatsch- und Abstrichproben von Arbeitsflächen, -geräten und Gegenständen mit Lebensmittelkontakt kann deren Belastung mit pathogenen Keimen festgestellt werden. Nach Reinigung und Desinfektion kann damit der Erfolg der Reinigung und Desinfektion überprüft werden. Außerdem können sie zur Überprüfung des Hygienestatus des Personals herangezogen werden.
Des Weiteren kann die Qualität des im Betrieb verwendeten Wassers mit direktem und indirektem Lebensmittelkontakt überprüft und eine Keimzahlbestimmung der Raumluft durchgeführt werden.